La AEF cuenta con los siguientes grupos de interés:
Grupo de Interés Fisioterapia en el Medio Acuático D. José Luis Aristín González
Grupo de Interés Fisioterapia en Salud Mental Dña. Antonia Gómez Conesa
Grupo de Interés Fisioterapia en Estrategias sobre Cronicidad de enfermedades D. Rafael Rodríguez Lozano
Grupo de Interés Fisioterapia en Pediatría
Grupo de Interés Fisioterapia en Salud de la Mujer Dña. Carmen Suárez Serrano
Grupo de Interés Fisioterapia en el Abordaje del Dolor D. Rafael Rodríguez Lozano